基因的 "文字处理器" - 科学家揭示生物编程的全新机制

摘要：Arc 研究所的科学家们发现了桥式重组酶机制，这是一种革命性的工具，可实现完全可编程的DNA重排。他们的发现详见最近发表在《自然》杂志上的文章，这是首个利用非编码RNA进行目标和供体 DNA 分子序列特异性选择的 DNA 重组酶。这种桥接 RNA 是可编程的，允许用户指定任何所需的基因组目标序列和任何要插入的供体 DNA 分子。 桥式重组酶机制的可视化。来源：视觉科学这项研究是与 Arc 研究所核心研究员、斯坦福大学生物化学助理教授 Silvana Konermann 和东京大学结构生物学教授 Hiroshi Nishimasu 的实验室合作完成的。桥式重组酶机制的可视化，突出显示供体和目标结合环。来源：视觉科学基因编程新时代该研究的资深作者、Arc 研究所核心研究员、加州大学伯克利分校生物工程助理教授 Patrick Hsu 博士说："桥式 RNA 系统是一种全新的生物编程机制。桥式重组可以通过序列特异性插入、切除、反转等方式普遍修改遗传物质，从而实现超越CRISPR的活体基因组文字处理器。"桥式重组系统源于插入序列 110（IS110）元件，它是无数种可转座元件（或称"跳跃基因"）中的一种，可在微生物基因组内部和之间进行剪切和粘贴。可转座元件遍布所有生命形式，并已进化成专业的 DNA 操作机器，以求生存。IS110元件非常简单，仅由一个编码重组酶的基因和侧翼DNA片段组成，而这些DNA片段直到现在仍是一个谜。可视化桥式重组酶机制，突出显示转座子 DNA 和基因组目标位点。来源：视觉科学桥式 RNA 的先进机制Hsu 实验室发现，当 IS110 从基因组中切除时，非编码 DNA 的末端会连接在一起，产生一个折叠成两个环的 RNA 分子--桥接 RNA。其中一个环路与 IS110 元本身结合，而另一个环路则与插入 IS110 元的目标 DNA 结合。桥接 RNA 是双特异性引导分子的第一个例子，它通过碱基配对相互作用指定目标 DNA 和供体 DNA 的序列。研究小组发现了桥式重组酶机制，这是一种以可编程方式重组和重排 DNA 的精确而强大的工具。桥式重组酶机制远远超越了CRISPR等可编程基因剪刀，它使科学家们不仅能指定要修改的目标DNA，还能指定要识别的供体材料，因此他们可以插入新的功能性遗传物质，剪除有问题的DNA，或反转任何两个感兴趣的序列。通过这段可视化桥式重组机制关键环节的视频短片，您可以了解更多信息。来源：视觉科学桥接 RNA 的每个环路都可独立编程，研究人员可以将感兴趣的目标 DNA 序列与供体 DNA 序列混合匹配。这意味着该系统可以远远超越其插入 IS110 元件本身的天然作用，而是能够将任何理想的基因载荷（如有缺陷的致病基因的功能拷贝）插入到任何基因组位置。在这项工作中，研究小组证明，在大肠杆菌中插入所需基因的效率超过 60%，对正确基因组位置的特异性超过 94%。共同第一作者、加州大学伯克利分校生物工程研究生尼克-佩里（Nick Perry）说："这些可编程桥接 RNA 将 IS110 与其他已知重组酶区分开来，后者缺乏 RNA 成分，无法进行编程。就好像桥接 RNA 是一个通用电源适配器，能让 IS110 与任何插座兼容"。Patrick Hsu、Nick Perry 和 Matt Durrant 讨论新发现的桥式重组酶机制。图片来源：Ray Rudolph合作研究和未来影响Hsu实验室与东京大学Hiroshi Nishimasu博士实验室的合作补充了他们的发现，这一发现也于6月26日发表在《自然》杂志上。Nishimasu 实验室利用低温电子显微镜确定了与目标 DNA 和供体 DNA 结合的重组酶桥 RNA 复合物的分子结构，并依次对重组过程的关键步骤进行了分析。Januka Athukoralage、Nicholas Perry、Silvana Konermann、Matthew Durrant、Patrick Hsu、James Pai 和 Aditya Jangid。图片来源：雷-鲁道夫随着进一步的探索和发展，桥接机制有望开创第三代 RNA 引导系统，超越 CRISPR 和 RNA 干扰（RNAi）的 DNA 和 RNA 切割机制，为可编程 DNA 重排提供统一机制。对于哺乳动物基因组设计桥式重组系统的进一步发展至关重要的是，桥式重组酶可以连接两条 DNA 链，而不会释放切割 DNA 片段--这避开了当前最先进基因组编辑技术的一个关键局限。"桥式重组机制解决了其他基因组编辑方法所面临的一些最基本的挑战，"研究共同负责人、Arc 公司资深科学家马修-达兰特（Matthew Durrant）说。"可编程地重新排列任意两个DNA分子的能力为基因组设计的突破打开了大门"。编译自/ScitechDaily 原文：https://m.cnbeta.com.tw/view/1437137.htm

三星放缓汽车半导体项目开发 未来将以人工智能芯片为战略核心

摘要：快速发展的汽车领域是三星近年来重点关注的半导体领域之一，特别是在人工智能（AI）和自动驾驶的的加持下，三星认为该市场存在巨大的机遇，预计未来五年内的年均增长率将达到17%，超过了移动领域的6%和高性能计算（HPC）的12%。三星希望将移动领域的开发经验和专业知识融入到汽车产品线，并积极扩大在该领域的影响力。 据外媒报道，近期三星调整了半导体领域的开发计划，将以人工智能芯片为战略核心，同时放缓汽车半导体项目的开发速度，这将对三星未来的芯片战略产生重大影响。三星正在进行业务和组织结构调整，对开发中的下一代Exynos Auto系列车用处理器（代号KITT3）重新做评估。原有开发团队里的部分工程师已被重新分配到人工智能SoC团队，这是现阶段三星芯片开发的重点，集中了100到150名专业的芯片设计人员。三星在2018年推出了“Exynos Auto”品牌，开始进军高性能汽车半导体市场。去年三星推出了Exynos Auto V920芯片，这是其面向新型车载信息娱乐（IVI）系统推出的第三代汽车芯片，并与现代汽车展开合作，将芯片搭载到后者2025年的新车型里。除了各种车用芯片外，三星还针对汽车半导体市场推出了针对性的存储解决方案和半导体工艺。有三星内部人士透露，将重点转向人工智能芯片开发是明确的，但目前还没有确定组织结构调整的具体内容。 原文：https://m.cnbeta.com.tw/view/1437136.htm

IGN调查：你最希望谁推出新掌机 V社得票最低

摘要：自Valve推出Steam Deck以来，越来越多的厂商看到了掌机市场的巨大潜力。国内厂商跟进最为积极，出现了五花八门的掌机。而近些年，也有传闻称微软，索尼也想进这一领域分一杯羹。 对此，著名媒体IGN在网站上做了一个调查，询问读者最希望哪一个厂商推出新掌机。根据调查，得票率如下：索尼：31.6%微软：24.2%任天堂：35.6%V社：8.7%让人意外的是，V社得票率最低，看来国外玩家对Steam Deck 2的期望并没有那么大，而得票最高的是任天堂。很明显，Switch后续机型在海外有着很高的期待。 原文：https://m.cnbeta.com.tw/view/1437135.htm

欧盟电动车临时关税将落地 4个月后做出最终决定

摘要：欧盟委员会发布公告称，自7月5日起正式对进口自中国的纯电动汽车征收临时反补贴税。当地时间7月4日，欧盟委员会发布公告称，自7月5日起正式对进口自中国的纯电动汽车征收临时反补贴税。 其中，上汽集团加征税率为37.6%，吉利为19.9%，比亚迪为17.4%；其它配合欧盟调查的车企平均加征税率为20.8%，未配合调查的车企加征税率为37.6%。同时欧盟还将继续保持和中国的讨论。与6月12日预先披露的数据相比，本次确定的临时加征的税率有所下调。欧盟委员会表示，这些临时关税将从2024年7月5日起适用，最长期限为四个月；在这四个月内，加征关税必须通过欧盟成员国的投票，并作出最终决定；成员国将在官方通报发布后14天内，以书面程序对临时措施进行表决。如果加征关税最终得到通过，新税率的适用期为5年；此外，特斯拉可能会在最终阶段获得单独计算的税率。7月4日，商务部发言人何亚东在例行新闻发布会上表示，对于欧盟对华电动汽车反补贴调查，中方已多次表示强烈反对，主张通过对话协商妥善处理经贸摩擦。此前，已有多个欧洲车企和行业协会明确表示反对欧盟加征临时关税的举措。德国汽车工业协会（VDA）发文称，对原产于中国的纯电动乘用车加征反补贴关税不符合欧盟的利益。此举伤害了欧洲消费者和欧洲公司，并阻碍了电动汽车在欧洲的普及，影响碳排放目标的达成，因此不符合欧盟的利益。宝马集团董事长齐普策发表评论称：“欧盟委员会对中国电动汽车加征关税是错误的决策。加征关税将会阻碍欧洲车企的发展，同时也会损害欧洲自身利益。贸易保护主义势必引发连锁反应：以关税回应关税，以孤立取代合作。对宝马集团来说，类似增加进口关税这样的保护主义措施，无法帮助企业提升全球竞争力。宝马集团坚定不移地拥护自由贸易。”德国大众汽车表示，反对征收此类“反补贴税”，称欧盟“这一决定的负面影响超过了对欧洲——尤其是对德国汽车行业的任何潜在利益”，“提高进口关税可能引发一系列严重的措施和反措施，导致贸易冲突升级”。 原文：https://m.cnbeta.com.tw/view/1437134.htm

苹果插足 OpenAI与微软“蜜月期”或已结束

摘要：去年，在经历了CEO萨姆·奥特曼（Sam Altman）被短暂罢免而引发的混乱之后，OpenAI对其董事会进行了改革，主要合作伙伴微软获得了无投票权的观察员席位。“奥特曼事件”是由OpenAI老董事会发起的，让微软措手不及。而获得OpenAI董事会的观察席位后，可以确保微软不再经历这样不愉快的意外。毕竟，微软已对OpenAI投入了130亿美元。 但如今，根据媒体的报道，苹果公司也将获得OpenAI董事会的一个观察员席位，与微软并驾齐驱。报道称，苹果App Store应用商店主管Phil Schiller将代表苹果出任OpenAI董事会观察员。与微软“真金白银”的投入不同，苹果尚未向OpenAI投入任何资金，但正在将OpenAI的模型免费集成到其设备中。不难想象，这三方之间的关系将来可能会变得多么尴尬。微软和苹果是长期的竞争对手，但很快都会使用OpenAI的模型，在其相互竞争的产品上为AI助手提供动力。即使按照美国AI行业过于舒适的标准，这三家公司之间的关系也不会太舒服。在一些董事会讨论期间，必须要进行大量回避，即便如此可能也无法避免出现矛盾。即使不考虑未来可能发生的争议，让苹果获得OpenAI董事会观察员席位的直接影响，也有很多需要消化的地方。首先，也是最明显的一点，微软与OpenAI这对恋爱的双方，越来越多地开始对冲其赌注。一段时间以来，微软一直在这样做。考虑到去年的动荡，这也不足为奇。今年3月，微软聘请了AI初创公司Inflection AI的联合创始人和几乎所有员工，并同意支付6.5亿美元，以获得Inflection的软件授权。有报道称，微软目前正在开发一款与GPT竞争的AI模型，Inflection联合创始人Mustafa Suleyman领导了这一工作。与此同时，最近也有迹象表明，OpenAI在与微软合作的同时也在主张自己的独立性。上周有报道称，OpenAI现在通过直接出售其AI模型访问权限获得的收入，要比来自微软的授权收入还要多。将ChatGPT构建到MacBook和iPhone中确实是一件大事，但给予苹果观察员角色将证实，OpenAI和微软已经不像以前看起来那么紧密地交织在一起。另外，根据媒体的报道，针对与OpenAI的合作，苹果可能也不会像几周前那样专一了。在上个月宣布与OpenAI合作时，OpenAI CEO奥特曼并未出现在苹果WWDC开发者大会的舞台上，而是坐在观众席上。此后的报道表明，苹果可能还将谷歌和Anthropic的AI模型整合到其平台中，以作为OpenAI ChatGPT的替代品。但除非苹果也计划在这些公司的董事会中担任观察员，否则苹果似乎将在很长一段时间内赋予OpenAI及其技术更高的地位。这些合作将能体现出苹果在开发自家顶级AI模型方面的进展。一旦苹果推出自家AI模型，并被证明具有竞争力，将大大降低苹果对任何此类合作的需求。 原文：https://m.cnbeta.com.tw/view/1437132.htm

全球最大核聚变项目宣布大幅延期 直言该技术2040年前不太可能商用

摘要：地球文明点亮“可控核聚变”技术的时间表，在本周出现了一次较大的延期——这也意味着我们大概率要等到2040年前后才有机会看到这种“无限清洁能源”投入大规模商用。 全球在建的最大实验性托卡马克核聚变反应堆——国际热核聚变实验反应堆（ITER）本周三宣布，这个项目将出现设立后的第二次延期，以及潜在建造费用的进一步上调。在中文媒体的语境中，托卡马克核聚变反应堆还有一个更形象的名字——“人造太阳”。项目旨在模拟使得太阳发光发热的核聚变过程。由于实现核聚变的原材料（海水中的氘和氚）在地球上极为丰富，且排放无污染，一旦人类能够掌握“造太阳”的技术，将有望实现“能源自由”。（反应堆概念图，来源：ITER）ITER计划最早在2006年获批，中国、欧盟、俄罗斯、印度、美国、日本、韩国七方同意共同出资。其中欧盟提供55%的资金，其余6国各分担9%。延期&加钱ITER组织的总干事彼得罗·巴拉巴斯基（Pietro Barabaschi）在周三召开的记者会上宣布，这个试验装置的关键节点将面临大幅延期。其中初步阶段的运行——启动等离子体实验的时间从2025年延后至2033年，更进一步的全氘-氚聚变实验节点预期将从2035年延后至2039年。ITER项目从2013年开始建设，此前曾在2016年提出过一次计划日程表的调整，并追加了预算。延期也意味着工程预算的进一步“膨胀”。最初立项的时候，ITER计划于2020年开始测试，对应耗资约为50亿欧元，此前该预算已经膨胀至200亿欧元。对于最新的预算，项目组目前正在测算中，计划于今年晚些时候提出。不过巴拉巴斯基在周三透露，增加的金额大约为50亿欧元。最新的延期，再一次说明了人类无法依靠“可控核聚变”技术来解决眼下迫在眉睫的问题。例如在未来十年里应对气候变化的压力，以及全球不断增长的能源需求。巴拉巴斯基也在发布会上强调，毫无疑问，ITER的延期并不是朝着正确的方向发展。他也强调：“就核聚变对人类当前面临问题的影响而言，我们不应等待核聚变来解决这些问题，这是不明智的。”被商业项目超过？与2006年时相比，ITER已经不是人类在核聚变项目上的“唯一希望”。包括中国在内，全球也有不少国家和商业组织，正在展开核聚变领域的尝试。所以ITER的又一次延期，也触及到了另一个敏感的问题：这个官方示范项目，是否会被私营企业超越？根据公开报道，老虎环球资本、比尔·盖茨、谷歌等投资的Commonwealth Fusion Systems，以及英国托卡马克能源公司都在使用ITER同类的（但规模较小）的反应堆，并计划在2030年节点前开始原型机测试。对于这个问题，巴拉巴斯基间接予以了回应。他表示“非常怀疑”任何承诺在2040年前实现商业化运营的公司能够按时完成。他说：“即使我们今天证明了热核聚变（技术），我不相信到2040年我们会有能力进行商业部署。我们必须解决其他一些技术问题，使其具有商业可行性。” 原文：https://m.cnbeta.com.tw/view/1437133.htm